论文中脚注和尾注是学术论文中重要的引用方式，但在知网查重时也需要注意处理。一种方法是将脚注和尾注中的引用内容进行适当修改，避免与其他文献完全相同。可以通过更改引用格式、增加自身理解和分析等方式进行处理。另外，还可以在脚注和尾注处添加个人见解或批注，以增加原创性。在处理脚注和尾注时，要确保引用内容的准确性的同时，也要注意避免与其他文献雷同。

另一种处理方法是在脚注和尾注处注明引用来源，并在正文中进行适当的重述和解释。这样不仅能够保留引用信息，还能够展现作者对文献内容的理解和吸收程度。此外，也可以尝试将脚注和尾注中的引用内容进行适当的概括或改写，以减少与其他文献的重复度。综合运用以上方法，可以有效处理论文中脚注和尾注在知网查重中的问题，确保学术作品的原创性和合法性。