论文免费查重软件通常支持的文件格式包括doc、docx、pdf、txt等常见格式，部分高级查重软件还支持rar、ppt、xls等格式。用户在选择使用免费查重软件时，应注意查看软件的文件格式支持列表，确保自己的文档能够被正确识别和检测。不同的软件可能对文件格式的支持有所差异，建议根据自身需求选择合适的查重软件。

除了常见的doc、docx、pdf、txt格式外，论文免费查重软件还可以支持类似ppt、xls、rar等格式的文件进行查重。这些软件通过对文档内容的分析和比对，帮助用户检测文档的原创性和重复率。在使用查重软件时，用户可以根据自己的文档格式选择合适的免费查重工具，以确保查重的准确性和全面性。